Saki et Satoru mènent des vies bien rangées. Elle travaille pour la santé publique, il est chercheur en optimisation des espèces.
Leur quotidien est bouleversé lors de la nuit de la fête des Monstres. Kamisu 66, leur village d'origine, subit une attaque de rats-monstres.
Ils se dirigent alors vers Tokyo à la recherche d'une arme bactériologique. Arriveront-ils à accomplir leur mission avant qu'il ne soit trop tard ?