1968. Les États-Unis procèdent à des expériences nucléaires secrètes dans les îles du Pacifique, mais les choses tournent mal pour le mystérieux Projet Brooklyn. Tandis que la CIA s'active à étouffer l'affaire, les services secrets du monde entier convergent vers les ruines de l'énigmatique cité de Nan Madol. De Phnom Penh aux profondeurs abyssales, MacGuffin et Alan Smithee font face à des dangereux adversaires...